Zarovnání sekvencí DNA a proteinů ve formátu FASTA
Typ souboru: Various data file
Soubory s příponou fasta lze obvykle nalézt jako soubory dat sekvencí DNA a proteinů ve formátu FASTA.
Kategorie typu souboru:
Various data file
Datum aktualizace: 22. července 2025
Přípona souboru fasta souvisí s formátem FASTA, který neobsahuje chromatogram, ale pouze řetězec sekvence (je to mnohem jednodušší formát).
Programy FASTA nacházejí oblasti lokální nebo globální (nové) podobnosti mezi proteinovými nebo DNA sekvencemi, buď vyhledáváním v databázích proteinů nebo DNA, nebo identifikací lokálních duplikací v rámci sekvence.
Jiné programy poskytují informace o statistické významnosti zarovnání. Stejně jako BLAST může být FASTA použit k odvození funkčních a evolučních vztahů mezi sekvencemi a také k identifikaci členů genových rodin.
Budete potřebovat specializované programy pro formát FASTA.
Různé formáty sekvencí DNA lze obvykle převádět mezi sebou ve speciálním programu.
ChromasPro (Microsoft Windows)
ChromasPro (Microsoft Windows)
ChromasPro (Microsoft Windows)
DNA Baser Sequence Aligner (Microsoft Windows)
Convertrix (Microsoft Windows)
OpenBabel (On-line services)
Tablet (Microsoft Windows)
OpenBio (Microsoft Windows)
SnapGene (Multiplatform)
GenBank to FASTA converter (Microsoft Windows)
ABI to FASTA converter (Microsoft Windows)
MultiFASTA Builder (Microsoft Windows)
DNA Baser Sequence Aligner (Microsoft Windows)
Language