fichier de scoring SAM
Type de fichier : Divers fichiers de données
L’extension de fichier .dist-rdb est utilisée par Sequence Alignment and Modeling (SAM). Un fichier .dist-rdb est un fichier de scores au format RDB créé par hmmscore.
Il contient des identifiants de séquence, des longueurs de séquence, des scores et des informations sur la méthode de scoring.
Catégorie de type de fichier :
Divers fichiers de données
Date de mise à jour : 3 octobre 2026
Sequence Alignment and Modeling (SAM) est une suite logicielle de bioinformatique destinée à l’analyse et à la modélisation de séquences. Dans les workflows SAM, les fichiers .dist-rdb stockent les résultats de scoring produits par hmmscore.
Le fichier enregistre les séquences évaluées, leurs longueurs, les scores calculés et des détails sur la méthode de scoring. Il s’agit d’un fichier de données auxiliaire de SAM plutôt que d’un format d’alignement généraliste.
SAM et ses outils associés sont disponibles pour les systèmes Linux et Unix. Comme il s’agit d’un fichier au format RDB spécifique à SAM, il est principalement utile dans les workflows utilisant le logiciel SAM.
Un fichier .dist-rdb peut être inspecté comme un fichier de données textuel à l’aide d’un éditeur de texte brut sous Linux ou Unix. Son contenu est principalement destiné au traitement par les outils SAM, en particulier le workflow qui utilise hmmscore, plutôt qu’à l’affichage dans une application bureautique généraliste.
Ce fichier de scoring SAM ne nécessite normalement pas de conversion. Il stocke les résultats pour une utilisation dans les workflows SAM, et sa conversion vers un autre format peut entraîner la perte des informations relatives à la méthode de scoring.
Si les scores sont nécessaires ailleurs, un utilisateur peut analyser le fichier avec un script et exporter les champs sélectionnés vers un format tabulaire général. Un tel export constitue une extraction de données, et non une conversion complète du fichier de scoring SAM.
Applications logicielles qui créent des fichiers dist-rdb:
Linux/Unix
Applications logicielles qui exécutent d’autres tâches impliquant des fichiers dist-rdb:
Linux/Unix
Language
