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Introducción
Para sorpresa de muchos, el popular software de cifrado de datos multiplataforma TrueCrypt fue inesperadamente terminado por sus desarrolladores el 29.5.2014. La razón oficial fue la aparición de algunos errores de seguridad en el software y la discontinuación del soporte para Microsoft Windows XP.
Algunas teorías conspirativas hablan sobre la presión de servicios secretos a los desarrolladores para incluir algún tipo de puerta trasera en TrueCrypt y en lugar de eso, el equipo decidió terminar el software. La verdad probablemente nunca se descubrirá, pero TrueCrypt tal como lo conocíamos - se ha ido.
Aunque aún puedes descargar e instalar la última versión de TrueCrypt, ya no puede usarse para cifrado - solo para descifrado de datos protegidos por TrueCrypt.
Cuando se lance la última versión en Windows, recibirás el mismo mensaje que se muestra en la captura de pantalla a continuación.

Por supuesto, aún puedes encontrar algunas versiones anteriores de TrueCrypt en sitios populares de descarga, pero no tendrás soporte ni futuras correcciones de errores o posibles puertas traseras.
Las descargas de versiones antiguas desde sitios no confiables también podrían ser trampas, llenas de malware, troyanos y otras porquerías que podrían comprometer tu computadora.
Debido a esto, muchos usuarios que usaban TrueCrypt ahora necesitan encontrar otro programa para asegurar sus datos. Algunos podrían no estar contentos con BitLocker y por eso hicimos una lista de las opciones de cifrado más populares actualmente como reemplazo de TrueCrypt.
Alternativas a TrueCrypt para Windows
BitLocker
BitLocker es recomendado por los desarrolladores de TrueCrypt como sustituto de su aplicación. Es desarrollado por Microsoft e integrado en algunas distribuciones de Microsoft Windows Vista, Windows 7 (Ultimate y Enterprise) y Windows 8 (Pro y Enterprise). Microsoft garantiza que no hay puerta trasera en BitLocker y elogia sus capacidades de cifrado.
Con él, los usuarios pueden proteger volúmenes de disco (unidades físicas y lógicas) así como discos extraíbles USB mediante un potente cifrado AES. Los datos pueden cifrarse usando contraseña, TPM (Trusted Platform Module), llave USB, o una combinación de estas opciones.
Probablemente opciones ideales para usuarios que quieren proteger sus datos pero no quieren complicarse mucho.

Encrypted File Service
Otra herramienta de cifrado de Microsoft disponible en las distribuciones Professional y Enterprise de Windows desde Windows 2000. Es capaz de cifrar archivos, así como carpetas.
Para usar esta herramienta de cifrado:
Abre el Explorador de Windows → Haz clic derecho en el archivo → Propiedades → Pestaña General → Haz clic en el botón Avanzado → Marca la casilla Cifrar contenido para proteger datos → y haz clic en Aceptar.
Tus datos ahora están cifrados y protegidos por tu certificado personal seguro EFS generado por Windows.
Puede que no sea el cifrado más potente, pero debería ser suficiente para el usuario común.

El contenido de un archivo cifrado con EFS solo es visible en el sistema donde fue cifrado. Para verlo en otra computadora, necesitarás exportar tu certificado de seguridad e importarlo en ese sistema. Este certificado también es necesario cada vez que reinstales tu computadora.
Para crear una copia de seguridad de tu certificado de seguridad:
Abre el Explorador de Windows → Haz clic derecho en el archivo cifrado → Propiedades → Pestaña General → Haz clic en el botón Avanzado → Haz clic en el botón Detalles → Haz clic en certificado → Haz clic en el botón Copiar claves...

Cryptainer LE
Una versión gratuita del software comercial de seguridad Cryptainer ME. Es capaz de un potente cifrado de 448 bits para archivos individuales, carpetas, particiones o incluso unidades USB.
También puede usarse para crear particiones virtuales seguras en tu disco para almacenar datos sensibles (100 MB de tamaño para la versión LE).
En general, un buen paquete de cifrado para Windows.

AES Crypt
AES Crypt es un software de cifrado de archivos multiplataforma que usa el estándar industrial Advanced Encryption Standard (AES) para cifrar de forma segura archivos sensibles con un algoritmo de cifrado de 256 bits. Es popular principalmente en la plataforma Linux pero funciona muy bien en Windows. Puedes descargarlo gratis.

Secure Folder
Otra herramienta de cifrado ligera que permite a los usuarios ocultar, bloquear y cifrar carpetas rápidamente mediante una interfaz simple. Usa cifrado AES de 256 bits y evita que se acceda, copie, mueva o elimine.

DiskCryptor
Una alternativa gratuita a BitLocker para Microsoft Windows que permite a los usuarios cifrar todas las particiones del disco, incluyendo la partición del sistema. Las versiones antiguas de DiskCryptor se basaban en el código de TrueCrypt, pero ahora el programa tiene su propio formato de cifrado con algoritmos AES, Twofish y Serpent.
Una gran ventaja de este programa es que es completamente abierto y gratuito.
VeraCrypt
Un fork de TrueCrypt que soluciona muchas vulnerabilidades y problemas de seguridad encontrados tras la auditoría de la aplicación original TrueCrypt.
VeraCrypt es capaz de crear un disco virtual cifrado (volumen) que el usuario puede montar como una imagen de disco, cifrar una partición completa o almacenamiento USB, crear una partición o unidad de almacenamiento que contenga un sistema operativo, etc.
VeraCrypt usa su propio formato de imagen de volumen de disco con extensión (hc) y también puede abrir volúmenes de disco TrueCrypt *.tc.

Conclusión
Todas estas alternativas poseen básicamente las mismas capacidades de cifrado que TrueCrypt, pero su gran desventaja es que no son multiplataforma, o no tienen un equivalente compatible en otras plataformas. Y precisamente eso era una gran ventaja de TrueCrypt: podías usarlo en computadoras Windows, Mac o Linux.