fichier de base de données de séquences Kestrel
Type de fichier : Fichier de base de données
Un fichier .kseqs est une base de données de séquences Kestrel utilisée par le système Sequence Alignment and Modeling.
Il contient des séquences encodées pour un traitement efficace par le programme hmmscore de Kestrel.
Catégorie de type de fichier :
Fichier de base de données
Date de mise à jour : 28 septembre 2026
Le format de Kestrel sequence database stocke une représentation encodée de séquences biologiques. Son encodage est optimisé pour Kestrel hmmscore plutôt que pour la lecture directe ou l’échange général de données.
Ce format appartient au Sequence Alignment and Modeling system, qui utilise des bases de données de séquences lors de la comparaison de séquences avec des modèles de Markov cachés profilés. Un fichier .kseqs constitue donc une ressource de base de données spécialisée pour ce software, et non un document autonome.
Le Sequence Alignment and Modeling system associé est disponible pour Linux et Unix. Comme les fichiers .kseqs sont liés au workflow de traitement de Kestrel, ils restent principalement utiles au sein de ce système.
Utilisez la version Linux ou Unix du Sequence Alignment and Modeling system, notamment ses outils hmmscore de Kestrel, pour utiliser un fichier .kseqs. Il s’agit d’un fichier de base de données, normalement fourni au logiciel en tant que ressource d’entrée plutôt qu’ouvert comme un document.
Un éditeur de texte général ou un tableur n’affichera pas correctement les séquences, car le fichier contient les données de séquence encodées de Kestrel.
Si des séquences sont nécessaires dans un autre format, utilisez les données de séquence originales, si elles sont disponibles, et créez le format requis avec un logiciel de séquences approprié.
Lorsque le fichier est nécessaire à Kestrel hmmscore, conservez-le au format .kseqs plutôt que de le convertir.
Applications logicielles qui créent des fichiers kseqs:
Linux/Unix
Applications logicielles qui exécutent d’autres tâches impliquant des fichiers kseqs:
Linux/Unix
Language
