File del database delle sequenze Kestrel
Tipo di file: File di database
Un file .kseqs è un database di sequenze Kestrel utilizzato dal sistema Sequence Alignment and Modeling.
Contiene sequenze codificate per un'elaborazione efficiente da parte del programma Kestrel hmmscore.
Categoria tipo di file:
File di database
Data aggiornamento: 28 settembre 2026
Il formato del database di sequenze Kestrel memorizza una rappresentazione codificata di sequenze biologiche. La sua codifica è ottimizzata per Kestrel hmmscore anziché per la lettura diretta o lo scambio generico di dati.
Il formato appartiene al sistema Sequence Alignment and Modeling, che utilizza database di sequenze durante il confronto delle sequenze con modelli di Markov nascosti di profilo. Un file .kseqs è quindi una risorsa di database specializzata per quel software, non un documento autonomo.
Il sistema Sequence Alignment and Modeling collegato è disponibile per Linux e Unix. Poiché i file .kseqs sono legati al workflow di elaborazione di Kestrel, rimangono utili principalmente all'interno di tale sistema.
Usa la versione Linux o Unix del Sequence Alignment and Modeling system, inclusi i suoi strumenti Kestrel hmmscore, per utilizzare un file .kseqs. Si tratta di un file di database e normalmente viene fornito al software come risorsa di input anziché essere aperto come documento.
Un editor di testo generico o un programma per fogli di calcolo non visualizzerà correttamente le sequenze, perché il file contiene i dati di sequenza codificati di Kestrel.
Se sono necessarie sequenze in un altro formato, utilizzare i dati delle sequenze originali, se disponibili, e creare il formato richiesto con un software per sequenze appropriato.
Quando il file è richiesto da Kestrel hmmscore, mantenerlo nel formato .kseqs invece di convertirlo.
App software che creano file kseqs:
Linux/Unix
Applicazioni software che gestiscono altre attività riguardanti file kseqs:
Linux/Unix
Language
