arquivo de banco de dados de sequências do Kestrel
Tipo de arquivo: arquivo de banco de dados
Um arquivo .kseqs é um banco de dados de sequências do Kestrel usado pelo sistema Sequence Alignment and Modeling.
Ele contém sequências codificadas para processamento eficiente pelo programa hmmscore do Kestrel.
Categoria do tipo de arquivo:
arquivo de banco de dados
Data de atualização: 28 de setembro de 2026
O formato de base de dados de sequências Kestrel armazena uma representação codificada de sequências biológicas. Sua codificação é otimizada para o Kestrel hmmscore, e não para leitura direta ou troca geral de dados.
O formato pertence ao sistema Sequence Alignment and Modeling, que usa bases de dados de sequências ao comparar sequências com modelos ocultos de Markov de perfil. Portanto, um arquivo .kseqs é um recurso de base de dados especializado desse software, e não um documento independente.
O sistema Sequence Alignment and Modeling vinculado está disponível para Linux e Unix. Como os arquivos .kseqs estão associados ao fluxo de processamento do Kestrel, eles continuam sendo úteis principalmente dentro desse sistema.
Use a versão para Linux ou Unix do Sequence Alignment and Modeling system, incluindo as ferramentas hmmscore do Kestrel, para usar um arquivo .kseqs. Ele é um arquivo de banco de dados e normalmente é fornecido ao software como um recurso de entrada, em vez de ser aberto como um documento.
Um editor de texto comum ou um programa de planilhas não exibirá as sequências corretamente, pois o arquivo contém dados de sequência codificados do Kestrel.
Se forem necessárias sequências em outro formato, use os dados de sequência originais, se disponíveis, e crie o formato necessário com software de sequências apropriado.
Quando o arquivo for necessário pelo Kestrel hmmscore, mantenha-o no formato .kseqs em vez de convertê-lo.
Aplicações de software que criam arquivos kseqs:
Linux/Unix
Aplicações de software que executam outras tarefas com arquivos kseqs:
Linux/Unix
Language
