arquivo Genome Variation Format
Tipo de arquivo: Vários arquivos de dados
Um arquivo .gvf contém dados de variação genômica no Genome Variation Format. O formato descreve características de alteração de sequência na resolução de nucleotídeos em relação a um genoma de referência.
Os arquivos GVF estão associados a ferramentas do Sequence Ontology e a fluxos de trabalho de anotação genômica.
Categoria do tipo de arquivo:
Vários arquivos de dados
Data de atualização: 22 de outubro de 2026
O Genome Variation Format é um formato simples e estruturado para descrever características de alterações de sequência na resolução de nucleotídeos em relação a um genoma de referência. É um formato de arquivo padrão para variações em sequências do genoma humano e também pode representar variações em outros genomas.
O GVF usa uma estrutura delimitada por tabulações baseada nas convenções do GFF3. Um arquivo pode conter informações sobre a sequência de referência, coordenadas genômicas, detalhes da variação, identificadores e atributos adicionais que descrevem cada característica.
A especificação foi publicada por Reese et al. na revista Genome Biology, 2010;11(8):R88. O GVF está associado ao projeto Sequence Ontology e pode ser usado com as Sequence Ontology Tools no Microsoft Windows.
Abra um arquivo .gvf com o Sequence Ontology Tools no Microsoft Windows para trabalhar com suas anotações de variações genômicas.
Como o GVF é um formato de dados genômicos baseado em texto, um editor de texto pode exibir seu conteúdo, mas não interpretará as coordenadas, as sequências de referência ou os atributos de variação como características genômicas.
Não existe uma conversão geral conhecida para um arquivo .gvf. GVF é um formato de troca de dados, portanto, a conversão só é apropriada quando outra ferramenta de análise genômica exige um formato diferente de variante ou anotação.
Use software compatível com GVF e com o formato de destino para exportar os dados e verifique se as coordenadas, as sequências de referência e os atributos de anotação foram preservados.
Programas para visualizar arquivos gvf:
Microsoft Windows
português
