STOCKHOLM

stockholm icon

Stockholm bioinformatický formát

Typ souboru: Various data file

Soubory s příponou stockholm jsou datové soubory s konkrétním obsahem sekvencí DNA/RNA proteinů.

Co je soubor stockholm?

Kategorie typu souboru:
Various data file

Datum aktualizace: 22. července 2025

Přípona souboru stockholm se používá pro formát víceřadého zarovnání sekvencí používaný Pfam, Rfam a Dfam k šíření zarovnání proteinových, RNA a DNA sekvencí.

Souborové formáty Stockholm mohou také používat přípony .sto nebo .stk.

Formát je prostý text a je navržen tak, aby byl čitelný jak pro člověka, tak pro stroj. Zahrnuje funkce pro reprezentaci anotací sekvencí, sekundární struktury a dalších informací, které mohou být spojeny s víceřadým zarovnáním sekvencí. Každý soubor ve formátu Stockholm začíná řádkem obsahujícím řetězec "# STOCKHOLM 1.0" a končí řádkem obsahujícím pouze "//".

Asociované akce programů se souborem stockholm:

Software, který může importovat soubory stockholm:

SnapGene icon SnapGene (Multiplatform)