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Stockholm-Bioinformatik-Format
Dateityp: Verschiedene Datendateien
Dateien mit der stockholm Erweiterung sind Datendateien mit spezifischen DNA/RNA-Proteinsequenzinhalten.
Dateityp-Kategorie:
Verschiedene Datendateien
Aktualisierungsdatum: 6. September 2025
Dateierweiterung stockholm wird für ein Multiple Sequence Alignment-Format verwendet, das von Pfam, Rfam und Dfam genutzt wird, um Protein-, RNA- und DNA-Sequenzalignment zu verbreiten.
Stockholm-Formatdateien können stattdessen auch die Endungen .sto oder .stk aufweisen.
Das Format ist Klartext und so gestaltet, dass es sowohl für Menschen als auch für Maschinen lesbar ist. Es enthält Features zur Darstellung von Sequenzannotation, Sekundärstruktur und anderen Informationen, die mit einem Multiple Sequence Alignment verknüpft werden können. Jede Datei im Stockholm-Format beginnt mit einer Zeile, die die Zeichenfolge „# STOCKHOLM 1.0“ enthält, und endet mit einer Zeile, die nur „//“ enthält.
Software-Apps, die stockholm Dateien importieren:
Multiplatform
Language
