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Format bio-informatique de Stockholm
Type de fichier : Divers fichiers de données
Les fichiers avec extension stockholm sont des fichiers de données contenant des séquences spécifiques d'ADN/ARN protéique.
Catégorie de type de fichier :
Divers fichiers de données
Date de mise à jour : 2 août 2025
L'extension de fichier stockholm est utilisée pour un format d'alignement multiple de séquences utilisé par Pfam, Rfam et Dfam, pour diffuser des alignements de séquences de protéines, d'ARN et d'ADN.
Les fichiers au format Stockholm peuvent également porter l'extension .sto ou .stk.
Le format est en texte brut et est conçu pour être à la fois lisible par l'homme et par la machine. Il inclut des fonctionnalités pour représenter des annotations de séquences, la structure secondaire, et d'autres informations pouvant être associées à un alignement multiple de séquences. Chaque fichier au format Stockholm commence par une ligne contenant la chaîne « # STOCKHOLM 1.0 », et se termine par une ligne contenant uniquement « // ».
Applications logicielles qui importent des fichiers stockholm:
Multiplatform
Language
