Soubor ve formátu SAM HMMER
Typ souboru: Různé datové soubory
.hmmer file obsahuje profilový skrytý Markovův model ve formátu HMMER pro systém Sequence Alignment and Modeling (SAM).
SAM používá tento model k reprezentaci sekvenčních vzorů a provádění analýzy sekvencí.
Kategorie typu souboru:
Různé datové soubory
Datum aktualizace: 29. září 2026
SAM HMMER format je textový formát pro ukládání dat profile hidden Markov modelů. Profilový HMM popisuje konzervované a variabilní pozice v rodině biologických sekvencí.
Formát patří do systému Sequence Alignment and Modeling, který používá hidden Markov models pro zarovnávání a modelování sekvencí. Soubor je jedním z model-data files používaných systémem SAM.
SAM je navržen pro systémy Linux a Unix. Soubor HMMER lze také prohlížet jako text, ale s jeho modelovými daty by měl pracovat software, který rozumí formátu SAM HMMER.
Otevřete soubor pomocí systému Sequence Alignment and Modeling v Linuxu nebo Unixu. Pro analýzu sekvencí použijte nástroje SAM, které čtou modely ve formátu HMMER.
Protože je tento formát založený na textu, může jeho obsah zobrazit editor prostého textu, ale ruční úprava modelu může způsobit, že jej nebude možné v systému SAM použít.
Soubor .hmmer se obvykle používá přímo jako soubor modelu SAM a nevyžaduje konverzi. Pokud je vyžadován jiný formát modelu, použijte nástroj SAM, který výslovně podporuje import nebo export příslušného formátu.
Soubor nepřejmenovávejte jako způsob převodu; změna přípony nezmění data modelu.
Aplikace, které mohou otevírat soubory hmmer:
Linux/Unix
Software, který může upravovat soubory hmmer:
Linux/Unix
Aplikace, které mohou uložit soubory hmmer:
Linux/Unix
Software, který může vytvářet soubory hmmer:
Linux/Unix
Language
