File in formato SAM HMMER
Tipo di file: Diversi file di dati
Un file .hmmer contiene un modello di Markov nascosto di profilo nel formato HMMER per il sistema Sequence Alignment and Modeling (SAM).
SAM utilizza il modello per rappresentare i pattern di sequenza ed eseguire l'analisi delle sequenze.
Categoria tipo di file:
Diversi file di dati
Data aggiornamento: 29 settembre 2026
Il formato SAM HMMER è un formato basato su testo per l'archiviazione dei dati dei modelli nascosti di Markov di profilo. Un HMM di profilo descrive le posizioni conservate e variabili in una famiglia di sequenze biologiche.
Il formato appartiene al sistema Sequence Alignment and Modeling, che utilizza modelli nascosti di Markov per l'allineamento e la modellazione delle sequenze. Il file è uno dei file di dati dei modelli utilizzati da SAM.
SAM è progettato per sistemi Linux e Unix. Un file HMMER può anche essere esaminato come testo, ma i suoi dati del modello devono essere gestiti con software che supporta il formato SAM HMMER.
Apri il file con il sistema Sequence Alignment and Modeling su Linux o Unix. Usa gli strumenti SAM che leggono modelli in formato HMMER per l'analisi delle sequenze.
Poiché il formato è basato su testo, un editor di testo semplice può visualizzarne il contenuto, ma la modifica manuale del modello potrebbe renderlo inutilizzabile da SAM.
Un file .hmmer viene normalmente utilizzato direttamente come file modello SAM e non richiede conversione. Se è necessario un formato modello diverso, utilizzare un'utility SAM che supporti esplicitamente l'importazione o l'esportazione del formato pertinente.
Non rinominare il file come metodo di conversione; modificare l'estensione non modifica i dati del modello.
Applicazioni software che possono aprire file hmmer:
Linux/Unix
Applicazioni software che possono modificare file hmmer:
Linux/Unix
Software in grado di salvare file hmmer:
Linux/Unix
App software che creano file hmmer:
Linux/Unix
Language
