Datei im SAM-HMMER-Format
Dateityp: Verschiedene Datendateien
Eine .hmmer-Datei enthält ein Profile Hidden Markov Model im HMMER-Format für das Sequence Alignment and Modeling System (SAM).
SAM verwendet das Modell, um Sequenzmuster darzustellen und eine Sequenzanalyse durchzuführen.
Dateityp-Kategorie:
Verschiedene Datendateien
Aktualisierungsdatum: 29. September 2026
Das SAM HMMER format ist ein textbasiertes Format zum Speichern von Daten zu Profile hidden Markov models. Ein Profile HMM beschreibt die konservierten und variablen Positionen in einer Familie biologischer Sequenzen.
Das Format gehört zum Sequence Alignment and Modeling system, das hidden Markov models für das Sequenz-Alignment und die Modellierung verwendet. Die Datei ist eine der von SAM verwendeten Modelldatendateien.
SAM wurde für Linux- und Unix-Systeme entwickelt. Eine HMMER-Datei kann auch als Text überprüft werden, aber ihre Modelldaten sollten mit Software verarbeitet werden, die das SAM HMMER format versteht.
Öffnen Sie die Datei mit dem Sequence Alignment and Modeling system unter Linux oder Unix. Verwenden Sie die SAM tools, die Modelle im HMMER-Format zur Sequenzanalyse lesen.
Da das Format textbasiert ist, kann ein Nur-Text-Editor den Inhalt anzeigen. Durch das manuelle Bearbeiten des Modells kann es jedoch für SAM unbrauchbar werden.
Eine .hmmer-Datei wird normalerweise direkt als SAM-Modolldatei verwendet und muss nicht konvertiert werden. Falls ein anderes Modellformat erforderlich ist, verwenden Sie ein SAM-Dienstprogramm, das den Import oder Export des entsprechenden Formats ausdrücklich unterstützt.
Benennen Sie die Datei nicht um, um sie zu konvertieren; das Ändern der Dateierweiterung ändert nicht die Modelldaten.
Software-Anwendungen, die hmmer Dateien öffnen können:
Linux/Unix
Software-Anwendungen, die hmmer Dateien bearbeiten können:
Linux/Unix
Software, die hmmer Dateien speichern kann:
Linux/Unix
Software-Apps, die hmmer Dateien erstellen:
Linux/Unix
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