Arquivo no formato SAM HMMER
Tipo de arquivo: Vários arquivos de dados
Um arquivo .hmmer contém um modelo oculto de Markov de perfil no formato HMMER para o sistema Sequence Alignment and Modeling (SAM).
O SAM usa o modelo para representar padrões de sequência e realizar análises de sequência.
Categoria do tipo de arquivo:
Vários arquivos de dados
Data de atualização: 29 de setembro de 2026
O formato SAM HMMER é um formato baseado em texto para armazenar dados de modelos ocultos de Markov de perfil. Um HMM de perfil descreve as posições conservadas e variáveis em uma família de sequências biológicas.
O formato pertence ao sistema Sequence Alignment and Modeling, que usa modelos ocultos de Markov para alinhamento e modelagem de sequências. O arquivo é um dos arquivos de dados de modelo usados pelo SAM.
O SAM foi projetado para sistemas Linux e Unix. Um arquivo HMMER também pode ser inspecionado como texto, mas seus dados de modelo devem ser manipulados com software compatível com o formato SAM HMMER.
Abra o arquivo com o sistema Sequence Alignment and Modeling no Linux ou Unix. Use as ferramentas SAM que leem modelos no formato HMMER para análise de sequências.
Como o formato é baseado em texto, um editor de texto simples pode exibir seu conteúdo, mas editar o modelo manualmente pode torná-lo inutilizável pelo SAM.
Um arquivo .hmmer normalmente é usado diretamente como um arquivo de modelo SAM e não precisa de conversão. Se for necessário um formato de modelo diferente, use um utilitário SAM que ofereça suporte explícito à importação ou exportação do formato relevante.
Não renomeie o arquivo como forma de convertê-lo; alterar a extensão não altera os dados do modelo.
Aplicações de software que podem abrir arquivos hmmer:
Linux/Unix
Aplicações de software que podem editar arquivos hmmer:
Linux/Unix
Software que pode salvar arquivos hmmer:
Linux/Unix
Aplicações de software que criam arquivos hmmer:
Linux/Unix
Language
