Archivo en formato SAM de HMMER
Tipo de archivo: Varios archivos de datos
Un archivo .hmmer contiene un modelo oculto de Markov de perfil en formato HMMER para el sistema Sequence Alignment and Modeling (SAM).
SAM utiliza el modelo para representar patrones de secuencia y realizar análisis de secuencias.
Categoría del tipo de archivo:
Varios archivos de datos
Fecha de actualización: 29 de septiembre de 2026
El formato SAM HMMER es un formato basado en texto para almacenar datos de modelos ocultos de Markov de perfil. Un HMM de perfil describe las posiciones conservadas y variables de una familia de secuencias biológicas.
El formato pertenece al sistema Sequence Alignment and Modeling, que utiliza modelos ocultos de Markov para la alineación y el modelado de secuencias. El archivo es uno de los archivos de datos de modelos utilizados por SAM.
SAM está diseñado para sistemas Linux y Unix. Un archivo HMMER también puede inspeccionarse como texto, pero sus datos de modelo deben gestionarse con software que comprenda el formato SAM HMMER.
Abra el archivo con el sistema Sequence Alignment and Modeling en Linux o Unix. Use las herramientas de SAM que leen modelos en formato HMMER para el análisis de secuencias.
Como el formato está basado en texto, un editor de texto plano puede mostrar su contenido, pero editar el modelo manualmente podría hacer que SAM no pueda utilizarlo.
Un archivo .hmmer normalmente se utiliza directamente como archivo de modelo de SAM y no necesita conversión. Si se requiere un formato de modelo diferente, utiliza una utilidad de SAM que admita explícitamente la importación o exportación del formato correspondiente.
No cambies el nombre del archivo como método de conversión; cambiar la extensión no modifica los datos del modelo.
Aplicaciones de software que pueden abrir archivos hmmer:
Linux/Unix
Aplicaciones de software que pueden editar archivos hmmer:
Linux/Unix
Software capaz de guardar archivos hmmer:
Linux/Unix
Aplicaciones de software que crean archivos hmmer:
Linux/Unix
Language
