SAM-Alignment-Datei
Dateityp: Verschiedene Datendateien
Eine PA2M-Datei ist eine Ausrichtungsdatei, die vom SAM (Sequence Alignment and Modeling system) verwendet wird. Sie speichert ausgerichtete Sequenzen im Sequenzformat zusammen mit Annotationen zu posterioren Wahrscheinlichkeiten.
Die Datei wird von pathprobs als Teil des Ausrichtungsverarbeitungs-Workflows von SAM erstellt.
Dateityp-Kategorie:
Verschiedene Datendateien
Aktualisierungsdatum: 27. September 2026
SAM ist eine Bioinformatik-Software für Sequenzalignment und Modellierung. Eine PA2M file enthält abwechselnd Sequenzdaten und Annotationen zu posterioren Wahrscheinlichkeiten und bewahrt ein Alignment zusammen mit den zugehörigen Wahrscheinlichkeitsinformationen auf.
Das Format ist für die Verwendung mit SAMs pathprobs-Tool und dem zugehörigen Workflow zur Alignment-Verarbeitung vorgesehen. SAM ist für Linux- und Unix-Systeme verfügbar.
Öffnen Sie eine PA2M-Datei mit der SAM-Software unter Linux oder Unix mithilfe von SAM-Tools, die die von pathprobs erzeugte Ausgabe unterstützen. Ein Texteditor kann den Inhalt der Datei im Sequenzformat anzeigen, interpretiert jedoch nicht das Alignment oder die Annotationen zu posterioren Wahrscheinlichkeiten.
Wenn ein anderes Alignment-Format benötigt wird, muss ein SAM utility oder ein benutzerdefiniertes Skript die Sequenz- und Posterior-Wahrscheinlichkeitsdaten analysieren und das Zielformat schreiben.
Bei der Konvertierung können die Posterior-Wahrscheinlichkeitsannotationen verworfen werden, wenn das Zielformat sie nicht unterstützt.
Software-Anwendungen, die andere Aufgaben mit pa2m Dateien ausführen:
Linux/Unix
Deutsch
