Formato de microscopía basado en TIFF para imágenes multidimensionales y metadatos OME-XML
Tipo de archivo:
OME-TIFF es un formato de imagen basado en TIFF diseñado para la microscopía científica. Almacena los píxeles de la imagen junto con metadatos OME-XML que describen dimensiones como el ancho, la altura, los canales, la profundidad, los puntos temporales, la resolución física y la información de adquisición.
Los archivos se pueden abrir con Fiji o ImageJ mediante el importador Bio-Formats. Otras aplicaciones compatibles incluyen QuPath, OMERO y el software compatible con la biblioteca Bio-Formats.
Categoría del tipo de archivo:
Fecha de actualización: 25 de septiembre de 2026
OME-TIFF combina el contenedor TIFF ampliamente compatible con el modelo de datos de Open Microscopy Environment (OME). Los metadatos OME-XML suelen estar integrados en el campo de descripción de TIFF, mientras que los datos de píxeles pueden distribuirse entre varias páginas o archivos TIFF. Esta estructura permite que un único conjunto de datos represente imágenes multidimensionales, incluidos Z-stacks, series temporales, canales y series de imágenes.
OME-TIFF está diseñado para conservar información de imágenes científicas que un TIFF convencional quizá no describa de forma coherente. Los metadatos pueden incluir nombres de canales, información de color, tamaños físicos de píxel, posiciones de la platina, fechas de adquisición, detalles del instrumento y relaciones entre planos de imagen. Los conjuntos de datos grandes pueden utilizar almacenamiento en mosaicos, compresión, BigTIFF o archivos complementarios en una disposición OME-TIFF de varios archivos.
El formato está asociado con la especificación OME y suele ser generado por cámaras científicas, sistemas de microscopía, plataformas de gestión de imágenes y utilidades de conversión. Los metadatos exactos y las opciones de compresión varían según la aplicación, por lo que la compatibilidad puede depender de la versión del modelo OME y de las funciones TIFF utilizadas.
Fiji, ImageJ y Bio-Formats ofrecen una amplia compatibilidad en Windows, macOS y Linux. QuPath puede abrir muchas imágenes OME-TIFF para flujos de trabajo de patología digital, mientras que OMERO puede importarlas y gestionarlas en instalaciones de servidor compatibles. Los visores TIFF básicos pueden mostrar algunos datos de píxeles, pero quizá ignoren la organización multidimensional o los metadatos OME.
En Windows, macOS o Linux, instala Fiji y selecciona File > Open, o utiliza el importador de Bio-Formats cuando se te solicite. Fiji suele ser la opción más segura para conservar y navegar por los canales, las Z-slices y los puntos temporales. QuPath es otra opción para imágenes de portaobjetos completos o de microscopía compatibles.
Para realizar análisis basados en servidores, carga la imagen en una instalación de OMERO compatible con OME-TIFF. Si un visor de escritorio indica que el archivo no es válido, confirma que todos los archivos complementarios estén presentes cuando el conjunto de datos utilice un diseño de varios archivos e intenta usar una versión actual de Bio-Formats.
Para la conversión en equipos de escritorio, usa la utilidad de línea de comandos Bio-Formats bfconvert o las herramientas de exportación de Bio-Formats de Fiji. Estas pueden convertir OME-TIFF a formatos como TIFF estándar, BigTIFF, JPEG, PNG u OME-Zarr, según las opciones seleccionadas y si el formato de destino puede conservar los datos multidimensionales y los metadatos. Los usuarios de Python también pueden usar bibliotecas como tifffile para flujos de trabajo científicos controlados.
Los convertidores en línea pueden aceptar imágenes TIFF pequeñas y convencionales, pero a menudo eliminan los metadatos OME-XML, no admiten conjuntos de datos de varios archivos o imponen límites al tamaño de carga. Para datos de investigación, es preferible usar un convertidor de escritorio o de línea de comandos; conserva el original sin modificar y verifica las dimensiones, la información de los canales, la resolución y los metadatos del archivo convertido antes de eliminar el archivo de origen.
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